Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2aP35436 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2aP35436 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Grin2aP35436 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2aP35436 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms