Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab20P35295 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms