Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa3P35173 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms