Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms