Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc1P34928 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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