Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Notch4P31695 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Notch4P31695 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Notch4P31695 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms