Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms