Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnd1P30999 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms