Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms