Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms