Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif5cP28738 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms