Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms