Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpbP28033 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpbP28033 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms