Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms