Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggta1P23336 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms