Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms