Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tap1P21958 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms