Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BdnfP21237 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BdnfP21237 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms