Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klra1P20937 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klra1P20937 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klra1P20937 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klra1P20937 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klra1P20937 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klra1P20937 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klra1P20937 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klra1P20937 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms