Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms