Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prim1P20664 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms