Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms