Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcaP20444 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms