Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou5f1P20263 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou5f1P20263 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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