Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox4i1P19783 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms