Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama1P19137 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama1P19137 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama1P19137 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms