Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms