Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18528 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18528 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18528 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18528 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18528 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms