Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs1P17533 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms