Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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