Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SptbP15508 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SptbP15508 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SptbP15508 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms