Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms