Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf1P15314 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf1P15314 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms