Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FosbP13346 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FosbP13346 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FosbP13346 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FosbP13346 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FosbP13346 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FosbP13346 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FosbP13346 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FosbP13346 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FosbP13346 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FosbP13346 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FosbP13346 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FosbP13346 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FosbP13346 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FosbP13346 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FosbP13346 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FosbP13346 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms