Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn1P12960 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms