Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a1P12813 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms