Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb1P12658 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms