Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms