Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms