Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lamp1P11438 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms