Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnp2P11378 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnp2P11378 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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