Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP11369 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP11369 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP11369 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolP11369 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolP11369 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolP11369 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolP11369 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolP11369 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolP11369 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP11369 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP11369 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms