Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms