Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms