Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms