Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc9P09633 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms