Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LtaP09225 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LtaP09225 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LtaP09225 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LtaP09225 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LtaP09225 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LtaP09225 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LtaP09225 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LtaP09225 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LtaP09225 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LtaP09225 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms