Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms