Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms