Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms